غربالگری بیوانفورماتیکی مهارکننده‌(های) پروتئاز NS3/4A ویروس هپاتیت سی از دو گیاه دارویی Cornus officinalis و Syzygium aromaticum

نویسندگان

چکیده مقاله:

Background: The hepatitis C virus (HCV) infection is a major global health problem and one of the common causes of mortality worldwide. Therefore, currently many studies have been focused on introducing novel and effective anti HCV agents especially plant materials. Therefore, the study was aimed to screening novel HCV protease inhibitor(s) from two medicinal plants including Cornus officinalis and Syzygium aromaticum using bioinformatics tools. Methods: For this purpose, first three dimension structures of HCV protease and dominant compounds of the plants were retrieval from Protein Data Bank (PDB) and Pubchem database respectively. In the next step, physicochemical properties and probable mutagenic and cytotoxicity effects of the phytochemicals were predicted using Swiss ADME and Toxtree software respectively. And finally, these molecules were subjected to molecular docking studies using iGemdock 2.1 software. Results: The results indicated that any of the phytochemical compounds have cytotoxicity and mutagenic properties. Results also showed that most studied compounds had strong and appropriate interaction with the NS3/4A enzyme especially in the protease region. Furthermore, the results indicated that six compounds including 1,2,6-Trigalloylglucose, Hyperoside, Isoquercitrin, Rhamnetin,  Ursolic acid and Methyl salicylate have more strong interactions to key amino acids in the active site of the enzyme . Conclusion: Based on the results it can be concluded that the mentioned compounds can be good candidates for in vitro and in vivo studies as novel anti-HCV agents.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

HPTLC-densitometry determination of triterpenic acids in Origanum vulgare, Rosmarinus officinalis and Syzygium aromaticum.

Spices play an important role in the chemoprevention and they can be a rich source of biologically active compounds such as triterpenes in the human diet. A method based on high performance thin-layer chromatography combined with densitometry for determination of ursolic and oleanolic acids in some common spices was elaborated. The prechromatographic derivatization with 1% of iodine solution wa...

متن کامل

شناسایی ترکیبات موجود در عصاره و اسانس گیاه میخک Syzygium aromaticum

میخک یکی از منابع مهم گیاهی از ترکیبات فنلی، آنتی اکسیدانی ، ضد سرطان، ضد درد می باشد که از دیر باز مورد استفاده قرار میگرفته است.با توجه به اهمیت عصاره ها و اسانس ها و کاربرد آن ها در صنایع مختلف به دلیل ویژگی های منحصر به فرد آنها، عصاره و اسانس گیاه میخک استخراج شد و تحت تجزیه شیمیایی قرار گرفت تا ترکیبات شیمیایی عصاره و اسانس آنشناسایی و ارزیابی گردد.استخراج عصاره توسط روش خیساندن انجام گرف...

متن کامل

ترکیب‌های شیمیایی و فعالیت ضد‌قارچی اسانس میخک‌هندی (Syzygium aromaticum L.)

هدف از این پژوهش، مطالعه فعالیت ضدقارچی گل میخک‌هندی (Syzygium aromaticum L.)، علیه سه پاتوژنAlternaria alternate، Botrytis cinerea و Fusarium solani جدا شده از میوه‎های گوجه‌فرنگی، گیلاس و سیب‌زمینی با اضافه کردن قارچ به محیط کشت آنها و همچنین شناسایی خاصیت ضد قارچی این اسانس به‌عنوان نگهدارنده مواد غذایی در برابر این پاتوژن‏ها می‎باشد. اسانس گیاه با استفاده از دستگاه کلونجر استخراج شد و شناسا...

متن کامل

Lipid profile, antiradical power and antimicrobial properties of Syzygium aromaticum oil ; Perfil lipídico, poder antirradicalario y propiedades antimicrobianas del aceite de Syzygium aromaticum

1 Agricultural Biochemistry Department, Faculty of Agriculture, Zagazig University, 44519 Zagazig, Egypt 2 Institute of Scientific Research and Revival of Islamic Heritage, Umm Al-Qura University, Makkah, Kingdom of Saudi Arabia 3 Microbial Biotechnology Department, National Research Center, Dokki 12622, Cairo, Egypt 4 Internationales Laboratorium für Biotechnologie und Consulting (ILBC GmbH), ...

متن کامل

Cornus officinalis Methanol Extract Upregulates Melanogenesis in Melan-a Cells

Cornus officinalis is widely distributed in Korea, and its fruit has been used to make as herbal drug for traditional medicine in Korea, Japan, and China because of its tonic, analgesic, and diuretic properties. However, the effects of C. officinalis methanol extract (COME) on melanogenesis remain poorly understood. We evaluated the melanogenic capability of COME in melan-a cells, which are imm...

متن کامل

ENHANCED COMPOUND-ENZYMES- -ASSISTED EXTRACTION OF POLYSACCHARIDES FROM Cornus officinalis

The process of ultrasonic-enhanced compound-enzymes-assisted extraction of polysaccharides from the fruit of Cornus officinalis was optimized by response surface methodology (RSM). The influence of three different factors on the yield of C. officinalis polysaccharides (COP) was studied. The results showed that the optimal conditions were extraction temperature 49.6 °C, ultrasound time 40.41 min...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


عنوان ژورنال

دوره 25  شماره 167

صفحات  69- 80

تاریخ انتشار 2018-05

با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.

کلمات کلیدی

کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023